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Ingenuity Systems verbessert den Arbeitsablauf für die experimentelle Transkriptom-Analyse einzelner Zellen

Redwood City, Kalifornien (ots/PRNewswire)

- Bei diesem Arbeitsablauf für die Genexpression kommen
genetische Systeme und Gen-Assays von Life Technologies Corporation
zum Einsatz
Ingenuity Systems, führender Anbieter von Informationslösungen
für Biowissenschaftler, gab heute bekannt, dass das Unternehmen
gemeinsam mit Life Technologies Corporation einen neuen Arbeitsablauf
für die Genexpressions-Analyse entwickelt hat. Bei diesem
Arbeitsablauf, der dem Wissenschaftler neue Wege zur Analyse und zum
Verständnis der Transkriptome einzelner Zellen, die für die
Stammzellenforschung und die Erforschung von Krankheiten wichtig
sind, eröffnet, kommen Ingenuitys IPA-Software und das
SOLiD(TM)-System und die TaqMan(R)-Genexpression-Assays und -Arrays
von Applied Biosystems zum Einsatz. Applied Biosystems gehört zu Life
Technologies.
Die Wissenschaftler von Life Technologies und Ingenuity haben
zusammengearbeitet, um auf der Grundlage der in einem Artikel in
Nature Methods
(http://www.nature.com/nmeth/journal/v6/n5/full/nmeth.1315.html)
veröffentlichten Daten, wo ganze Transkriptom-Analysen mithilfe des
SOLiD-Systems durchgeführt und einzelne Wildtypzellen mit Zellen, bei
denen ausgewählten Gene ausgeschaltet waren, verglichen wurden, ein
gemeinsames Protokoll zu entwickeln. Die Ergebnisse wurden mithilfe
von TaqMan-Assays für die quantitative Echtzeit-PCR validiert.Das
Team setzte anschliessend die IPA-Software ein, um die funktionalen
Auswirkungen der globalen Genexpressionsstörung zu verstehen und auf
die entscheidenden Signalwege und zellulären Vorgänge einzugrenzen.
Mit diesen Informationen konnte die IPA-Software die Wissenschaftler
bei der Aufstellung überprüfbarer Hypothesen für Folgeexperimente
unterstützten, die mit TaqMan-Assays zur Validierung der
Transaktionsänderungen durchgeführt wurden.
"Eines unserer Hauptziele ist es, mithilfe der IPA-Software
sicherzustellen, dass die gefundenen Erkenntnisse aus den
Genexpressionsprofilen dazu genutzt werden können, optimale
Folgeexperimente festzulegen", sagte Peter DiLaura, Senior Vice
President Marketing und Produkte bei Ingenuity Systems. "Dieses
gemeinsame Protokoll, bei dem die Lösungen von Applied Biosystems und
die IPA-Software zum Einsatz kommen, ermöglichte es den
Wissenschaftlern, von einem Experiment zum nächsten voranzuschreiten
und auf diese Weise schnell relevante biologische Erkenntnisse zu
gewinnen, wie z.B. entscheidenden Mechanismen, Funktionen und
Signalwege, um anschliessend eine Möglichkeit aufzuzeigen, wie diese
Erkenntnisse eingesetzt werden können, um Validierungsstudien zu
entwickeln, die den Wissenschaftler dabei unterstützen, normale und
krankhafte Prozesse in der Zelle besser zu verstehen."
Falls Sie mehr über diese Art der Forschung erfahren möchten,
nehmen Sie am 29. Oktober oder 3. November gemeinsam mit Ingenuity
und Life Technologies an den kostenlosen Webinars teil. Hier können
Sie sich dazu anmelden: http://www.ingenuity.com/news/events/091029_t
ranscriptome_analysis.html.
Informationen zu IPA(R)
IPA ist eine umfassende Softwareanwendung mit deren Hilfe
Wissenschaftler die komplexen biologischen und chemischen Systeme
modellieren, analysieren und verstehen können, die im Mittelpunkt der
biowissenschaftlichen Forschung stehen. Weitergehende Informationen
stehen unter www.ingenuity.com zur Verfügung.
Informationen zu Ingenuity Systems(R)
Ingenuity Systems ist ein führender Anbieter von
Informationslösungen und kundenspezifischen Dienstleistungen für
Forscher im Bereich der Biowissenschaften, für computerorientierte
Biologen und Bioinformatiker sowie Zulieferer der
Biowissenschaftsbranche. Weitergehende Informationen stehen unter
www.ingenuity.com zur Verfügung.

Pressekontakt:

Heidi Bullock, Marketingleiterin bei Ingenuity Systems, Tel.:
+1-650-381-5150

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